Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Trim68Q8K243 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim68Q8K243 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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