Protein–RNA interactions for Protein: Q8K194

Snrnp27, U4/U6.U5 small nuclear ribonucleoprotein 27 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp27Q8K194 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrnp27Q8K194 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Snrnp27Q8K194 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp27Q8K194 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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