Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHX7

Rftn2, Raftlin-2, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn2Q8CHX7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rftn2Q8CHX7 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rftn2Q8CHX7 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms