Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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