Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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