Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp27Q8CEG8 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp27Q8CEG8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms