Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG5

Ccdc28b, Coiled-coil domain-containing protein 28B, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28bQ8CEG5 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc28bQ8CEG5 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Ccdc28bQ8CEG5 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc28bQ8CEG5 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc28bQ8CEG5 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc28bQ8CEG5 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ccdc28bQ8CEG5 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ccdc28bQ8CEG5 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ccdc28bQ8CEG5 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ccdc28bQ8CEG5 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ccdc28bQ8CEG5 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ccdc28bQ8CEG5 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ccdc28bQ8CEG5 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ccdc28bQ8CEG5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ccdc28bQ8CEG5 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc28bQ8CEG5 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc28bQ8CEG5 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc28bQ8CEG5 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms