Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDU5

Efhb, EF-hand domain-containing family member B, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EfhbQ8CDU5 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EfhbQ8CDU5 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
EfhbQ8CDU5 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
EfhbQ8CDU5 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
EfhbQ8CDU5 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
EfhbQ8CDU5 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
EfhbQ8CDU5 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
EfhbQ8CDU5 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
EfhbQ8CDU5 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
EfhbQ8CDU5 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
EfhbQ8CDU5 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms