Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDE2

Ccin, Calicin, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcinQ8CDE2 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CcinQ8CDE2 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CcinQ8CDE2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CcinQ8CDE2 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CcinQ8CDE2 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CcinQ8CDE2 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CcinQ8CDE2 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CcinQ8CDE2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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