Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCC3

Uncharacterized protein C12orf56 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CCC3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8CCC3 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8CCC3 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8CCC3 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8CCC3 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8CCC3 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8CCC3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8CCC3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8CCC3 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8CCC3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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