Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Gm29755-201ENSMUST00000196976 948 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Gm44366-201ENSMUST00000204933 674 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Gm44226-201ENSMUST00000205203 1195 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Gm7762-201ENSMUST00000220595 604 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Klra7-203ENSMUST00000088011 921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Vmn2r125-201ENSMUST00000096794 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Mndal-204ENSMUST00000188804 2026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Gm14713-201ENSMUST00000122362 686 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Vmn2r-ps66-201ENSMUST00000173203 1256 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Krr1-204ENSMUST00000174653 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Gm19030-201ENSMUST00000194947 552 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Gm43177-201ENSMUST00000197032 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Gm44138-201ENSMUST00000204939 271 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 C030038I04Rik-201ENSMUST00000207840 740 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Gm45625-201ENSMUST00000209412 650 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Olfr858-ps1-201ENSMUST00000212591 930 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 AC154527.3-201ENSMUST00000225519 989 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Rida-201ENSMUST00000022946 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Olfr121-201ENSMUST00000074555 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Rpl31-201ENSMUST00000086535 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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