Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctdsp2Q8BX07 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctdsp2Q8BX07 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctdsp2Q8BX07 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctdsp2Q8BX07 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctdsp2Q8BX07 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctdsp2Q8BX07 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctdsp2Q8BX07 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctdsp2Q8BX07 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctdsp2Q8BX07 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctdsp2Q8BX07 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctdsp2Q8BX07 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctdsp2Q8BX07 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctdsp2Q8BX07 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctdsp2Q8BX07 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctdsp2Q8BX07 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctdsp2Q8BX07 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctdsp2Q8BX07 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctdsp2Q8BX07 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctdsp2Q8BX07 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctdsp2Q8BX07 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctdsp2Q8BX07 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctdsp2Q8BX07 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctdsp2Q8BX07 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctdsp2Q8BX07 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctdsp2Q8BX07 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctdsp2Q8BX07 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctdsp2Q8BX07 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctdsp2Q8BX07 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctdsp2Q8BX07 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctdsp2Q8BX07 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctdsp2Q8BX07 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctdsp2Q8BX07 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctdsp2Q8BX07 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctdsp2Q8BX07 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctdsp2Q8BX07 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctdsp2Q8BX07 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctdsp2Q8BX07 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctdsp2Q8BX07 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctdsp2Q8BX07 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctdsp2Q8BX07 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctdsp2Q8BX07 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctdsp2Q8BX07 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctdsp2Q8BX07 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctdsp2Q8BX07 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctdsp2Q8BX07 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctdsp2Q8BX07 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctdsp2Q8BX07 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctdsp2Q8BX07 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctdsp2Q8BX07 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctdsp2Q8BX07 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctdsp2Q8BX07 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctdsp2Q8BX07 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctdsp2Q8BX07 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctdsp2Q8BX07 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctdsp2Q8BX07 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctdsp2Q8BX07 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctdsp2Q8BX07 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctdsp2Q8BX07 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctdsp2Q8BX07 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctdsp2Q8BX07 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctdsp2Q8BX07 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctdsp2Q8BX07 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctdsp2Q8BX07 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctdsp2Q8BX07 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctdsp2Q8BX07 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctdsp2Q8BX07 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctdsp2Q8BX07 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctdsp2Q8BX07 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctdsp2Q8BX07 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctdsp2Q8BX07 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctdsp2Q8BX07 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctdsp2Q8BX07 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctdsp2Q8BX07 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctdsp2Q8BX07 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctdsp2Q8BX07 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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