Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
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Usp38Q8BW70 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Usp38Q8BW70 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Usp38Q8BW70 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Usp38Q8BW70 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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