Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUM9

Usp43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, mousemouse

Predictions only

Length 1,132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp43Q8BUM9 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Usp43Q8BUM9 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Usp43Q8BUM9 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp43Q8BUM9 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp43Q8BUM9 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp43Q8BUM9 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp43Q8BUM9 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp43Q8BUM9 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp43Q8BUM9 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp43Q8BUM9 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp43Q8BUM9 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp43Q8BUM9 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp43Q8BUM9 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp43Q8BUM9 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp43Q8BUM9 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp43Q8BUM9 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp43Q8BUM9 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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