Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMQ2

Gtf3c4, General transcription factor 3C polypeptide 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c4Q8BMQ2 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c4Q8BMQ2 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c4Q8BMQ2 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c4Q8BMQ2 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c4Q8BMQ2 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c4Q8BMQ2 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c4Q8BMQ2 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c4Q8BMQ2 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c4Q8BMQ2 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c4Q8BMQ2 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c4Q8BMQ2 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c4Q8BMQ2 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c4Q8BMQ2 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c4Q8BMQ2 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c4Q8BMQ2 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c4Q8BMQ2 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c4Q8BMQ2 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c4Q8BMQ2 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c4Q8BMQ2 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c4Q8BMQ2 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c4Q8BMQ2 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c4Q8BMQ2 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c4Q8BMQ2 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c4Q8BMQ2 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf3c4Q8BMQ2 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf3c4Q8BMQ2 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf3c4Q8BMQ2 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf3c4Q8BMQ2 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf3c4Q8BMQ2 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf3c4Q8BMQ2 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf3c4Q8BMQ2 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf3c4Q8BMQ2 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf3c4Q8BMQ2 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf3c4Q8BMQ2 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gtf3c4Q8BMQ2 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf3c4Q8BMQ2 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf3c4Q8BMQ2 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf3c4Q8BMQ2 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf3c4Q8BMQ2 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms