Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms