Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH88

Depdc1b, DEP domain-containing protein 1B, mousemouse

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Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depdc1bQ8BH88 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Depdc1bQ8BH88 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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