Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Atg4dQ8BGV9 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Atg4dQ8BGV9 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Atg4dQ8BGV9 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Atg4dQ8BGV9 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg4dQ8BGV9 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg4dQ8BGV9 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg4dQ8BGV9 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg4dQ8BGV9 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg4dQ8BGV9 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg4dQ8BGV9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg4dQ8BGV9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg4dQ8BGV9 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg4dQ8BGV9 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg4dQ8BGV9 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg4dQ8BGV9 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg4dQ8BGV9 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg4dQ8BGV9 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg4dQ8BGV9 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg4dQ8BGV9 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg4dQ8BGV9 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg4dQ8BGV9 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg4dQ8BGV9 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg4dQ8BGV9 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg4dQ8BGV9 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg4dQ8BGV9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg4dQ8BGV9 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg4dQ8BGV9 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg4dQ8BGV9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg4dQ8BGV9 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg4dQ8BGV9 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg4dQ8BGV9 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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