Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8BGC1 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8BGC1 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8BGC1 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BGC1 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BGC1 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BGC1 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms