Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

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Length 757 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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Htatsf1Q8BGC0 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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Htatsf1Q8BGC0 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Htatsf1Q8BGC0 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms