Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms