Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kdm5bQ80Y84 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm5bQ80Y84 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms