Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Zbed4Q80WQ9 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zbed4Q80WQ9 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zbed4Q80WQ9 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zbed4Q80WQ9 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zbed4Q80WQ9 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zbed4Q80WQ9 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zbed4Q80WQ9 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zbed4Q80WQ9 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Zbed4Q80WQ9 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Zbed4Q80WQ9 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zbed4Q80WQ9 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zbed4Q80WQ9 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Zbed4Q80WQ9 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Zbed4Q80WQ9 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zbed4Q80WQ9 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Zbed4Q80WQ9 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zbed4Q80WQ9 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zbed4Q80WQ9 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zbed4Q80WQ9 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zbed4Q80WQ9 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zbed4Q80WQ9 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zbed4Q80WQ9 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zbed4Q80WQ9 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zbed4Q80WQ9 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zbed4Q80WQ9 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zbed4Q80WQ9 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zbed4Q80WQ9 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zbed4Q80WQ9 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zbed4Q80WQ9 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zbed4Q80WQ9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zbed4Q80WQ9 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zbed4Q80WQ9 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zbed4Q80WQ9 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zbed4Q80WQ9 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zbed4Q80WQ9 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zbed4Q80WQ9 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zbed4Q80WQ9 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zbed4Q80WQ9 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Zbed4Q80WQ9 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zbed4Q80WQ9 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zbed4Q80WQ9 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zbed4Q80WQ9 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zbed4Q80WQ9 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zbed4Q80WQ9 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zbed4Q80WQ9 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zbed4Q80WQ9 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zbed4Q80WQ9 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms