Protein–RNA interactions for Protein: Q80UG8

Ttll4, Tubulin polyglutamylase TTLL4, mousemouse

Predictions only

Length 1,193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll4Q80UG8 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttll4Q80UG8 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ttll4Q80UG8 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ttll4Q80UG8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ttll4Q80UG8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ttll4Q80UG8 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ttll4Q80UG8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ttll4Q80UG8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttll4Q80UG8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttll4Q80UG8 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttll4Q80UG8 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttll4Q80UG8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttll4Q80UG8 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttll4Q80UG8 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttll4Q80UG8 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttll4Q80UG8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttll4Q80UG8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttll4Q80UG8 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttll4Q80UG8 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttll4Q80UG8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttll4Q80UG8 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttll4Q80UG8 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttll4Q80UG8 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttll4Q80UG8 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttll4Q80UG8 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttll4Q80UG8 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttll4Q80UG8 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttll4Q80UG8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttll4Q80UG8 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttll4Q80UG8 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttll4Q80UG8 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttll4Q80UG8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttll4Q80UG8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttll4Q80UG8 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttll4Q80UG8 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttll4Q80UG8 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttll4Q80UG8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttll4Q80UG8 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttll4Q80UG8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttll4Q80UG8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttll4Q80UG8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttll4Q80UG8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ttll4Q80UG8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ttll4Q80UG8 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms