Protein–RNA interactions for Protein: Q80U22

Rusc2, Iporin, mousemouse

Predictions only

Length 1,514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rusc2Q80U22 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rusc2Q80U22 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rusc2Q80U22 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rusc2Q80U22 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rusc2Q80U22 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rusc2Q80U22 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rusc2Q80U22 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rusc2Q80U22 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rusc2Q80U22 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rusc2Q80U22 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rusc2Q80U22 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rusc2Q80U22 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rusc2Q80U22 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rusc2Q80U22 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rusc2Q80U22 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rusc2Q80U22 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rusc2Q80U22 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rusc2Q80U22 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rusc2Q80U22 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rusc2Q80U22 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rusc2Q80U22 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rusc2Q80U22 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rusc2Q80U22 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rusc2Q80U22 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rusc2Q80U22 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rusc2Q80U22 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rusc2Q80U22 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rusc2Q80U22 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rusc2Q80U22 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rusc2Q80U22 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rusc2Q80U22 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rusc2Q80U22 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rusc2Q80U22 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms