Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Shq1Q7TMX5 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Shq1Q7TMX5 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Shq1Q7TMX5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Shq1Q7TMX5 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Shq1Q7TMX5 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Shq1Q7TMX5 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Shq1Q7TMX5 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Shq1Q7TMX5 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Shq1Q7TMX5 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Shq1Q7TMX5 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Shq1Q7TMX5 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Shq1Q7TMX5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Shq1Q7TMX5 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Shq1Q7TMX5 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Shq1Q7TMX5 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Shq1Q7TMX5 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Shq1Q7TMX5 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Shq1Q7TMX5 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Shq1Q7TMX5 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Shq1Q7TMX5 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Shq1Q7TMX5 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Shq1Q7TMX5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Shq1Q7TMX5 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Shq1Q7TMX5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Shq1Q7TMX5 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Shq1Q7TMX5 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Shq1Q7TMX5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Shq1Q7TMX5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Shq1Q7TMX5 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Shq1Q7TMX5 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Shq1Q7TMX5 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Shq1Q7TMX5 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Shq1Q7TMX5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Shq1Q7TMX5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Shq1Q7TMX5 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Shq1Q7TMX5 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Shq1Q7TMX5 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Shq1Q7TMX5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Shq1Q7TMX5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Shq1Q7TMX5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Shq1Q7TMX5 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Shq1Q7TMX5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Shq1Q7TMX5 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Shq1Q7TMX5 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Shq1Q7TMX5 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Shq1Q7TMX5 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Shq1Q7TMX5 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Shq1Q7TMX5 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Shq1Q7TMX5 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Shq1Q7TMX5 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms