Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Trappc6aQ78XR0 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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