Protein–RNA interactions for Protein: Q78PY7

Snd1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snd1Q78PY7 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snd1Q78PY7 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms