Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmed3Q78IS1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmed3Q78IS1 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmed3Q78IS1 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmed3Q78IS1 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmed3Q78IS1 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmed3Q78IS1 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmed3Q78IS1 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmed3Q78IS1 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmed3Q78IS1 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmed3Q78IS1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmed3Q78IS1 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmed3Q78IS1 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmed3Q78IS1 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmed3Q78IS1 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmed3Q78IS1 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmed3Q78IS1 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmed3Q78IS1 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmed3Q78IS1 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmed3Q78IS1 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmed3Q78IS1 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmed3Q78IS1 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmed3Q78IS1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmed3Q78IS1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmed3Q78IS1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmed3Q78IS1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmed3Q78IS1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmed3Q78IS1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmed3Q78IS1 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmed3Q78IS1 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmed3Q78IS1 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmed3Q78IS1 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmed3Q78IS1 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmed3Q78IS1 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmed3Q78IS1 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmed3Q78IS1 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmed3Q78IS1 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmed3Q78IS1 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmed3Q78IS1 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmed3Q78IS1 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmed3Q78IS1 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmed3Q78IS1 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmed3Q78IS1 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmed3Q78IS1 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmed3Q78IS1 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmed3Q78IS1 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmed3Q78IS1 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmed3Q78IS1 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmed3Q78IS1 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmed3Q78IS1 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmed3Q78IS1 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tmed3Q78IS1 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tmed3Q78IS1 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tmed3Q78IS1 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tmed3Q78IS1 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tmed3Q78IS1 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tmed3Q78IS1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tmed3Q78IS1 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tmed3Q78IS1 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tmed3Q78IS1 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tmed3Q78IS1 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tmed3Q78IS1 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tmed3Q78IS1 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tmed3Q78IS1 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms