Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SynmQ70IV5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms