Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.8 ms