Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms