Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Gm22388-201ENSMUST00000158194 248 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Gm28342-201ENSMUST00000190308 589 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Gm38135-201ENSMUST00000195068 502 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Asf1a-204ENSMUST00000219271 725 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 AC187103.3-201ENSMUST00000225725 646 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 P2rx1-202ENSMUST00000092938 1119 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms