Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ93

Usp34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, mousemouse

Predictions only

Length 3,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp34Q6ZQ93 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp34Q6ZQ93 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms