Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc44a1Q6X893 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Slc44a1Q6X893 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc44a1Q6X893 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc44a1Q6X893 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc44a1Q6X893 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc44a1Q6X893 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc44a1Q6X893 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc44a1Q6X893 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc44a1Q6X893 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc44a1Q6X893 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc44a1Q6X893 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc44a1Q6X893 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc44a1Q6X893 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc44a1Q6X893 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc44a1Q6X893 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc44a1Q6X893 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc44a1Q6X893 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc44a1Q6X893 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc44a1Q6X893 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc44a1Q6X893 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc44a1Q6X893 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc44a1Q6X893 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc44a1Q6X893 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc44a1Q6X893 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc44a1Q6X893 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc44a1Q6X893 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc44a1Q6X893 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc44a1Q6X893 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc44a1Q6X893 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc44a1Q6X893 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms