Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms