Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc85bQ6PDY0 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms