Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SvoplQ6PDF3 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms