Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Trak1Q6PD31 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms