Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Herc4Q6PAV2 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Herc4Q6PAV2 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms