Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc3bQ6NWW9 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms