Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVL5

Lcn12, Epididymal-specific lipocalin-12, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn12Q6JVL5 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lcn12Q6JVL5 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lcn12Q6JVL5 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lcn12Q6JVL5 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lcn12Q6JVL5 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Lcn12Q6JVL5 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lcn12Q6JVL5 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lcn12Q6JVL5 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Lcn12Q6JVL5 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lcn12Q6JVL5 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Lcn12Q6JVL5 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lcn12Q6JVL5 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lcn12Q6JVL5 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lcn12Q6JVL5 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lcn12Q6JVL5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lcn12Q6JVL5 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lcn12Q6JVL5 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lcn12Q6JVL5 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lcn12Q6JVL5 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lcn12Q6JVL5 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lcn12Q6JVL5 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lcn12Q6JVL5 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lcn12Q6JVL5 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Lcn12Q6JVL5 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lcn12Q6JVL5 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lcn12Q6JVL5 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lcn12Q6JVL5 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lcn12Q6JVL5 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lcn12Q6JVL5 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Lcn12Q6JVL5 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lcn12Q6JVL5 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lcn12Q6JVL5 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lcn12Q6JVL5 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Lcn12Q6JVL5 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lcn12Q6JVL5 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Lcn12Q6JVL5 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lcn12Q6JVL5 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Lcn12Q6JVL5 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Lcn12Q6JVL5 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Lcn12Q6JVL5 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lcn12Q6JVL5 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lcn12Q6JVL5 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Lcn12Q6JVL5 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lcn12Q6JVL5 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Lcn12Q6JVL5 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lcn12Q6JVL5 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lcn12Q6JVL5 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lcn12Q6JVL5 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lcn12Q6JVL5 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Lcn12Q6JVL5 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
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Lcn12Q6JVL5 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Lcn12Q6JVL5 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lcn12Q6JVL5 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lcn12Q6JVL5 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lcn12Q6JVL5 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lcn12Q6JVL5 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Lcn12Q6JVL5 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Lcn12Q6JVL5 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lcn12Q6JVL5 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Lcn12Q6JVL5 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Lcn12Q6JVL5 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lcn12Q6JVL5 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lcn12Q6JVL5 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lcn12Q6JVL5 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lcn12Q6JVL5 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lcn12Q6JVL5 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Lcn12Q6JVL5 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lcn12Q6JVL5 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lcn12Q6JVL5 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lcn12Q6JVL5 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lcn12Q6JVL5 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lcn12Q6JVL5 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lcn12Q6JVL5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lcn12Q6JVL5 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms