Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms