Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV12

Kdsr, 3-ketodihydrosphingosine reductase, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KdsrQ6GV12 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KdsrQ6GV12 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
KdsrQ6GV12 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
KdsrQ6GV12 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
KdsrQ6GV12 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
KdsrQ6GV12 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
KdsrQ6GV12 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
KdsrQ6GV12 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
KdsrQ6GV12 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
KdsrQ6GV12 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KdsrQ6GV12 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms