Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Carmil1Q6EDY6 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms