Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Smarca2Q6DIC0 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Smarca2Q6DIC0 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms