Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Cep290Q6A078 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Cep290Q6A078 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Cep290Q6A078 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Cep290Q6A078 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Cep290Q6A078 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cep290Q6A078 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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