Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG3

Spty2d1, Protein SPT2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spty2d1Q68FG3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Spty2d1Q68FG3 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spty2d1Q68FG3 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms