Protein–RNA interactions for Protein: Q64213

Sf1, Splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf1Q64213 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sf1Q64213 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf1Q64213 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms