Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc18Q640L5 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms